实验室现有设备总价值2212万元，其中单台（件）超过20万元的设备共26台（件），包括：气相色谱-质谱-闻香仪联用（GC-MS-O）、离子色谱仪、超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱联用仪（Q-TOF）、气相色谱仪（GC）、全二维气相色谱仪、全自动凯氏定氮仪、纤维素测定仪、流式细胞仪、多功能酶标仪、快速样品破碎仪、真空冷冻干燥机、固态发酵系统、液相色谱（LC）、超高放大倍率连续变焦视频显微镜系统、全自动菌落分析仪、总有机质分析仪、粗纤维测定仪、自动热脱附件系统、等离子体质谱仪、袖珍式厌氧工作站等。

目前建设有多粮浓香型白酒研究及中试基地、酱腌菜和调味品研究基地、微生物基因资源研究基地、微生物利用研究基地调味品研究中试基地、酱腌菜研究中试基地。

现有科研用房分属于依托单位宜宾五粮液股份有限公司、宜宾学院及微生物基因资源研究基地江南大学工业生物技术教育部重点实验室、微生物药物研究基地贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室，共4000m2。

配套设施主要有依托单位宜宾五粮液股份有限公司制曲、酿造多个中试车间，总面积500m2；调味品资源研究中试基地四川保宁醋有限公司中试车间120m2；酱腌菜资源研究中试基地宜宾市南溪区三江食品有限公司中试窖80m2。